עמלק היה פילוסוף ומחקר וכופר בעקר, ומשם נמשך דעת הפילוסופים הכופרים בכל התורה, ואומרים שעקר השגת התכלית הוא על־ידי הפילוסופיה והחקירות, ומחציפים פניהם כל־כך עד שאפלו מצות מעשיות שבתורה מפרשים רק על שכליות וחכמות שלהם, וכופרים בפשוטו לגמרי. וכל זה הוא מבחינת עמלק, שהוא האבן־נגף שיש בכל חכמה מהשבע חכמות, שעל־ידי־זה מי שנכנס לאלו החכמות יוכל להחליק ולפל, חס ושלום על־ידי האבן־נגף הנ"ל. והכנעתו הוא על־ידי אמונה שלמה ומצות מעשיות ועבודת השם בפשיטות ובתמימות גמור, בלי שום חכמות, והעקר על־ידי עבודת התפלה, כי התפלה משנה הטבע, ונתבטלין ממילא החכמות והחקירות שהם הולכים על־פי הטבע; וזה עקר התכלית אצלנו, שתהיה התפלה נכללת באחדותו יתברך, בבחינת "הוא תהלתך והוא אלקיך".